Muchos consideran que Deus Ex es uno de los mejores RPGs hechos, lo que, en comparación, deja a su secuela como una de las decepciones más grandes. Pero la tercera entrega, no tendrá a ninguno de sus creadores originales involucrados, así que es difícil saber cómo saldrá. Y a pesar de haber sido anunciado en 2007, aún no sabemos casi nada sobre su desarrollo. Hasta ahora entendemos que tomará lugar en 2027, 25 años antes del primer Deus Ex. En ese momento, los agregados nanotecnológicos no se habían inventado y la mayoría de las mejoras eran simplemente biomecánicas. Sobre cómo se conectará éste título con el primero, solo sabemos que los eventos ocurridos en ésta secuela darán a la creación de la organización, UNATCO, la coalición anti-terrorista del primer juego. Deus Ex 3 saldrá en algún momento de 2010 para PC y, posiblemente, para otras plataformas.
